Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N5

TMEM216, Transmembrane protein 216, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM216Q9P0N5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM216Q9P0N5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM216Q9P0N5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM216Q9P0N5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM216Q9P0N5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM216Q9P0N5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms