Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT2Q9NZN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT2Q9NZN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNOT2Q9NZN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT2Q9NZN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT2Q9NZN8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms