Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK13-1Q9NX77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVK13-1Q9NX77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms