Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA3Q9NST1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA3Q9NST1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNPLA3Q9NST1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms