Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTG1Q9NSN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTG1Q9NSN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms