Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP2Q9NS61 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms