Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHPT1Q9NRX4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHPT1Q9NRX4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHPT1Q9NRX4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms