Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRAC1Q9NRG0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRAC1Q9NRG0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRAC1Q9NRG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRAC1Q9NRG0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms