Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECTIN3Q9NQS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN3Q9NQS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN3Q9NQS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms