Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEPEQ9NQ76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEPEQ9NQ76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEPEQ9NQ76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms