Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL40Q9NQ50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL40Q9NQ50 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms