Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL47Q9HD33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL47Q9HD33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MRPL47Q9HD33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms