Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PRKRIP1Q9H875 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PRKRIP1Q9H875 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRKRIP1Q9H875 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms