Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMYD3Q9H7B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMYD3Q9H7B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD3Q9H7B4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms