Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASSF4Q9H2L5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF4Q9H2L5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms