Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B3GNT4Q9C0J1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B3GNT4Q9C0J1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B3GNT4Q9C0J1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
B3GNT4Q9C0J1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms