Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
LNPKQ9C0E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
LNPKQ9C0E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms