Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B0

UNK, RING finger protein unkempt homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UNKQ9C0B0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UNKQ9C0B0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UNKQ9C0B0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UNKQ9C0B0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UNKQ9C0B0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UNKQ9C0B0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UNKQ9C0B0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UNKQ9C0B0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms