Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC13A1Q9BZW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC13A1Q9BZW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A1Q9BZW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC13A1Q9BZW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms