Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM54Q9BYV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM54Q9BYV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms