Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARD6BQ9BYG5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARD6BQ9BYG5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms