Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM4Q9BWF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms