Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HIRIP3Q9BW71 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HIRIP3Q9BW71 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HIRIP3Q9BW71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HIRIP3Q9BW71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms