Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB2BQ9BVA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TUBB2BQ9BVA1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB2BQ9BVA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms