Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPOQ9BU64 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPOQ9BU64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPOQ9BU64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPOQ9BU64 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms