Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRADC1Q9BSG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRADC1Q9BSG0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRADC1Q9BSG0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms