Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FERMT1Q9BQL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FERMT1Q9BQL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FERMT1Q9BQL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms