Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLX1AQ9BQ83 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLX1AQ9BQ83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms