Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3AQ99856 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3AQ99856 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3AQ99856 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3AQ99856 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms