Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDF2Q99470 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDF2Q99470 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDF2Q99470 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms