Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOLD1Q96LR9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOLD1Q96LR9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOLD1Q96LR9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms