Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALPK3Q96L96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALPK3Q96L96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALPK3Q96L96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALPK3Q96L96 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms