Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJD4Q96KN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJD4Q96KN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GJD4Q96KN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJD4Q96KN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms