Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX4I2Q96KJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX4I2Q96KJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms