Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPTM1LQ96KA5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPTM1LQ96KA5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPTM1LQ96KA5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms