Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
DCHS1Q96JQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DCHS1Q96JQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms