Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCPIP1Q96JH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCPIP1Q96JH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCPIP1Q96JH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCPIP1Q96JH7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms