Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIC2Q96JB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIC2Q96JB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIC2Q96JB3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms