Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A3Q96HJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A3Q96HJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms