Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPNQ96H22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPNQ96H22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPNQ96H22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms