Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL48Q96GC5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms