Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23CQ96ET8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23CQ96ET8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TVP23CQ96ET8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms