Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM44Q96DX7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM44Q96DX7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms