Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP3Q96CW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP3Q96CW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms