Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDF1Q96CC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF1Q96CC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF1Q96CC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms