Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf49Q96BT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf49Q96BT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf49Q96BT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms