Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VTI1AQ96AJ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VTI1AQ96AJ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VTI1AQ96AJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VTI1AQ96AJ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTI1AQ96AJ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms