Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFT1Q96AA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RFT1Q96AA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFT1Q96AA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms