Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED12Q93074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED12Q93074 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED12Q93074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED12Q93074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED12Q93074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED12Q93074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED12Q93074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED12Q93074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED12Q93074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED12Q93074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED12Q93074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED12Q93074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED12Q93074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED12Q93074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED12Q93074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED12Q93074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED12Q93074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED12Q93074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED12Q93074 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED12Q93074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED12Q93074 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED12Q93074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED12Q93074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED12Q93074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED12Q93074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED12Q93074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED12Q93074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED12Q93074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED12Q93074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED12Q93074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED12Q93074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED12Q93074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED12Q93074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED12Q93074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED12Q93074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED12Q93074 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms