Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8BQ92930 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB8BQ92930 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB8BQ92930 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB8BQ92930 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms